区域经济研究所成立于2001年。研究方向涉及金融创新与经济发展、农村金融、区域与城市经济、农业经济与管理、国际经济与贸易、民营经济与企业管理等。主要任务是结合吉林区域经济发展实际，承担省委、省政府等部门的重大课题，对我国尤其是吉林区域经济发展中的重大现实问题进行理论和对策研究；同时也接受地方政府部门和企事业单位的委托承担相关应用研究课题。多年来，围绕吉林经济转型发展、“三农”问题、城市化、块状经济与产业集群、农业经济、数字经济等主题广泛开展研究，取得了一大批重要的研究成果，丰富和深化了改革开放和发展的理论，为省委、省政府的相关决策提供了科学依据，并为有关市县和企业提供了咨询服务。研究团队先后出版学术专著20余部，在国内外期刊上发表论文200余篇，有30多篇被全国和吉林省重要报刊全文转载。2010年以来，区域经济研究所承担了“吉林省现代农业投融资机制创新研究”“外商直接投资技术溢出对吉林省经济增长的影响机制研究”等省级以上课题30余项。