2008年，“医药中间体吉林省高等学校工程研究中心”被吉林省发改委确认为吉林省省级工程研究中心。工程中心以有机化学、无机化学、物理化学和分析化学4个二级学科为支撑，主要研究含呋喃环医药中间体的合成与工艺、含氮杂环医药中间体的合成及农药的清洁生产。
工程中心现有人员40人，包括6位教授、1位研究员、9位副教授、9位高级工程师，其中有2位博士生导师，18位博士。现有科研用房1650余平方米，中试生产线2条，仪器设备总价值1417.6万元。
近年来，工程中心人员共承担国家级科研项目2项，省部级科研项目16项。其中有4项科研成果已进行转化。研究成果获得吉林省科学技术进步奖等各类奖项14项，申报发明专利8项，获专利授权3项，128篇论文被SCI、EI收录。
